1. Guzmán-Salas, S., Weber, A., Malci, A., Lin, X., Herrera-Molina, R., Cerpa, W., Dorador, C., Signorelli, J., Zamorano, P. The metabolite p-cresol impairs dendritic development, synaptogenesis, and synapse function in hippocampal neurons: Implications for autism spectrum disorder. Journal of Neurochemistry 161(4):335-349.(2022)
2. MATÍAS LIRA , RODRIGO G. MIRA , FRANCISCO J. CARVAJAL , PEDRO ZAMORANO , NIBALDO C. INESTROS, AND WALDO CERPA. GLUTAMATERGIC RECEPTOR TRAFFICKING AND DELIVERY: ROLE OF THE EXOCYST COMPLEX. CELLS. 9(11), 2402; 2020. HTTPS://DOI.ORG/10.3390/CELLS9112402.
3. Dirk Schulze-Makuch, Daniel Lipus 2 , Felix L. Arens , Mickael Baqué , Till L. V. Bornemann , Jean-Pierre deVera , Markus Flury , Jan Frösler , Jacob Heinz 1 , Yunha Hwang , Samuel P. Kounaves , Kai Mangelsdorf , Rainer U. Meckenstock , Mark Pannekens , Alexander J. Probst , Johan S. Sáenz , Janosch Schirmack, Michael Schloter , Philippe Schmitt-Kopplin, Beate Schneider, Jenny Uhl, Gisle Vestergaard, Bernardita Valenzuela, Pedro Zamorano and Dirk Wagner. Microbial Hotspots in Lithic Microhabitats Inferred from DNA Fractionation and Metagenomics in the Atacama Desert. Microorganisms. 9, 1038. 2021 https://doi.org/10.3390/microorganisms9051038

4. Qian Zhang, Marco Campos, Giovanni Larama, Jacquelinne J. Acuña, Bernardita Valenzuela, Francisco Solis, Pedro Zamorano, Rubén Araya, Michael J. Sadowsky, Milko A. Jorquera. Composition and predicted functions of the bacterial community in spouting pool sediments from the El Tatio Geyser feld in Chile. Archives of Microbiology. 203:389–397 .2021

5. Lira M, Arancibia D, Orrego P, Montenegro-Venegas C, Cruz Y, García J, Leal-Ortiz S, Godoy JA, Guldenfinger E, Inestrosa NC, Garner C, Zamorano P, Torres V. The Exocyst component Exo70 modulates dendrite arbor formation, synapse density and spine maturation in primary hippocampal neurons. Molecular Neurobiology. 56: 4620-4638, 2019 DOI:10.1007/s12035-018-1378-0

6. Escobar-Aguirre S, Arancibia D, Escorza A, Bravo C, Andrés ME, Zamorano P, Martínez V. Development of a bicistronic vector for the expression of a CRISPR/Cas9-mCherry system in fish cell lines. Cells 8: E75, 2019 DOI: 10.3390/cells8010075.

7. Arancibia D, Lira M, Cruz Y, Barrera DP, Montenegro-Venegas C, Godoy JA, Garner CC, Inestrosa NC, Gundelfinger ED, Zamorano P, Torres VI. Serine-Arginine Protein Kinase SRPK2 Modulates the Assembly of the Active Zone Scaffolding Protein CAST1/ERC2. Cells 8: E1333. 2019 doi: 10.3390/cells8111333.

8. Vera-Villalobos H, Lunario-Delgado L, Pérez-Retamal D, Román D, Leiva JC, Zamorano P, Mercado-Seguel A, Gálvez AS, Benito C, Wulff-Zottele C. Sulfate nutrition improves short-term Al3+-stress tolerance in roots of Lolium perenne L. Plant Physiol Biochem. 148:103-113. 2020 DOI: 10.1016/j.plaphy.2020.01.011.

9. Zhang Q, Campos M, Larama G, Acuña JJ, Valenzuela B, Solis F, Zamorano P, Araya R, Sadowsky MJ, Jorquera MA. Composition and predicted functions of the bacterial community in spouting pool sediments from the El Tatio Geyser field in Chile. Arch Microbiol. 203:389-397. 2020 DOI: 10.1007/s00203-020-02020-9.

10. Lira M, Mira R, Carvajal F, Zamorano P, Inestrosa N, Cerpa W. Glutamatergic receptor trafficking and delivery: Role of the Exocyst Complex. Cells 9: 2402, 2020 DOI: 10.3390/cells9112402.

11. Melo F, Caballero L, Zamorano E, Ventura N, Navarro C, Doll I, Zamorano P, Cornejo A. The cytotoxic effect of α-synuclein aggregates. Chemphyschem. 22: 526-532, 2021. DOI: 10.1002/cphc.202000831.

12. Lira M, Zamorano P, Cerpa W. Exo70 intracellular redistribution after repeated mild traumatic brain injury. Biological Research 54: 5, 2021. DOI: 10.1186/s40659-021-00329-3.

13. Santos A, Bruna P, Martines-Urtaza, Solis F, Valenzuela B, Zamorano P, Barrientos L. Two Archaeal Metagenome-Assembled Genomes from El Tatio Provide New Insights into the Crenarchaeota Phylum. Genes 12: 391, 2021. DOI: 10.3390/genes12030391

14. Zarate R, Arancibia D, Fernandez A, Signorelli J, Larrondo L, André E, Zamorano P. Optimization of the Light-On system in a lentiviral platform to a light-controlled expression of genes in neurons. Electronic Journal of Biotechnology. 51: 50-57, 2021 DOI 10.1016/j.ejbt.2021.03.006

15. Schulze-Makuch D, Lipus D, Arens FL, Baqué M, Bornemann TLV, de Vera JP, Flury M, Frösler J, Heinz J, Hwang Y, Kounaves SP, Mangelsdorf K, Meckenstock RU, Pannekens M, Probst AJ, Sáenz JS, Schirmack J, Schloter M, Schmitt-Kopplin P, Schneider B, Uhl J, Vestergaard G, Valenzuela B, Zamorano P, Wagner D. Microbial Hotspots in Lithic Microhabitats Inferred from DNA Fractionation and Metagenomics in the Atacama Desert. Microorganisms. 9:1038. 2021 DOI: 10.3390/microorganisms9051038.

16. The metabolite p-cresol impairs dendritic development, synaptogenesis and synapse function in hippocampal neurons: Implications for autism spectrum disorder. Journal Neurochemistry 2022 (ACCEPTED). DOI:10.1111/jnc.15604

INVESTIGADOR PRINCIPAL EN PROYECTOS MAS RECIENTES.

1. FSEQ210003 Rhizosphere extreme microbiomeconsortium (REMC): A national network for a multiomic-based approach for a rational design, build and prospection of microbial consortia from extreme environment plants to mitigate the megadrought in chile. 2022

2. BMBF150065 Neuroplastin goes presynaptic implications for endo/exocytosis and the exocyst complex. Proyectos de Investigación Conjunta CONICYT Chile – BMBF Alemania, 2017-2019

3. FONDECYT #1110944: Assembly of active zones through a prion-like aggregation mechanism: Assessing prion-like features of poly-Q domains of the presynaptic proteins Piccolo and Bassoon. 2011-2014

PROJECTS CO-INVESTIGADOR.

1. FIC-R 2015. Desarrollos tecnológicos para la industria acuícola perlera de abalón en la segunda región. 2016-2018.

2. DIRINV # 1315: Rol de la proteína ERC2 en la formación de la zona activa presináptica durante la sinaptogénesis del cerebro de rata 2006-2008

3. FIC #4591 Desarrollo de una estrategia molecular para promover el crecimiento del Abalón juvenil 2009

4. FIC #4517: Uso de la hormona de crecimiento de Dorado para inducir crecimiento de juveniles de Dorado (Seriola lalandi). 2009-2010

5. FIC #4521: Fortalecimiento de competencias moleculares aplicadas a la industria alimenticia: Caracterización genética y producción recombinante de amilasas termoestables de microorganismos termófilos con potencial uso en la industria de alimentos.

1. Camila Jesús Tapia Cisternas, Bioquímica. Estudio de la formación de agregados de los dominios poli-Q de las proteínas presinápticas Piccolo y Bassoon en células heterólogas, cultivos neuronales y el efecto de estos dominios en la sinaptogénesis de neuronas hipocampales (En revision 2019)

2. Duxan Andrés Arancibia Radich, Bioquímica. Rol de la familia de las quinasas de proteínas ricas en dipéptidos serina-arginina (SRPKs) sobre la sinaptogénesis de neuronas hipocampales en cultivo. (Finalizada 2015)

3. Leslie Sánchez Becerra, Bioquímica. Caracterización de bacterias termófilas (Geobacillus sp.) etanol tolerantes provenientes de la macrozona norte de chile (Finalizada 2016)

4. Rafaella Victoria Zárate Canales, Bioquímica. Desarrollo de un sistema optogenético para el control espacio-temporal de la expresión de genes en mamíferos mediado por vectores lentivirales: expresión regulada de la proteína reportera mcherry como prueba de concepto (Finalizada 2018)

5. Mayra Callo, Biotecnología. Identificación y expresión de genes codificantes para lipasas/esterasas termoestables provenientes de bacterias termófilas aisladas desde la cuenca geotermal El Tatio. (Ejecución 2019)

1. Camila Jesús Tapia Cisternas, Bioquímica. Estudio de la formación de agregados de los dominios poli-Q de las proteínas presinápticas Piccolo y Bassoon en células heterólogas, cultivos neuronales y el efecto de estos dominios en la sinaptogénesis de neuronas hipocampales (En revision 2019)

2. Duxan Andrés Arancibia Radich, Bioquímica. Rol de la familia de las quinasas de proteínas ricas en dipéptidos serina-arginina (SRPKs) sobre la sinaptogénesis de neuronas hipocampales en cultivo. (Finalizada 2015)

3. Leslie Sánchez Becerra, Bioquímica. Caracterización de bacterias termófilas (Geobacillus sp.) etanol tolerantes provenientes de la macrozona norte de chile (Finalizada 2016)

4. Rafaella Victoria Zárate Canales, Bioquímica. Desarrollo de un sistema optogenético para el control espacio-temporal de la expresión de genes en mamíferos mediado por vectores lentivirales: expresión regulada de la proteína reportera mcherry como prueba de concepto (Finalizada 2018)

5. Mayra Callo, Biotecnología. Identificación y expresión de genes codificantes para lipasas/esterasas termoestables provenientes de bacterias termófilas aisladas desde la cuenca geotermal El Tatio. (Ejecución 2019)

DIRECCION DE TESIS POSTGRADO MAS RECIENTES

1. Lucia Alejandra Barra Espejo, (c) Doctorado en Cs. Biológicas. Dominios PoliQ de Piccolo y Bassoon: Determinantes moleculares para el ensamblaje de la zona activa a través de un mecanismo de reclutamiento tipo prión.

2. Juan Carlos Leiva, (c) Doctorado en Cs. Biológicas. Desarrollo de un vector probiótico para expresión de la hormona de crecimiento de Seriola lalandi en el manejo acuícola de Dorado: Prueba de concepto en células epiteliales ASK.

3. Sheyla Guzmán (c) Doctorado en Cs. Biológicas. Potencial rol de metabolito bacteriano intestinal p-cresol en autismo: Impacto sobre morfología neuronal y el comportamiento de ratas. Profesor Cotutor

4. Duxan Arancibia, Doctorado en Cs. Biológicas PUC. Role of cerebral dopamine neurotrophic factor in endoplasmic reticulum stress. Profesor Cotutor Externo Finalizada 2019

5. Rafaella Zárate, Doctorado en Cs. Biológicas PUC. Parkinsonian phenotype in a Drosophila PINK1 mutant: Study of serotonergic system during pre-symptomatic stages. Profesor Cotutor Externo

6. Yocelin Cruz Huanuco, (c) Magíster en Cs, Biomédicas. Rol de Serine-Arginine rich protein kinases (SRPKs) 2 y 3 en la agregación de la proteína ERC2 y su efecto sobre el ensamblaje de la zona activa. (Finalizada 2014)

7. Marysol Paz Fiblas, (c) Magíster en Cs, Biomédicas. “Estrategias moleculares para la entrega de la hormona de crecimiento de Seriola lalandi etiquetada con el péptido Tat para la modulación endocrina de especies acuícolas en cultivo” (Finalizada 2015)

8. Francisco Solís, (c) Magíster en Cs, Biomédicas. Caracterización molecular de una serina-proteasa secretadas de la cepa Thermus sp (801) aislada en la cuenca de “El Tatio” a través del data mining del genoma de la cepa Thermus thermophilus HB27. (Finalizada Mayo 2017)

9. Jonathan García Araya, (c) Magíster en Cs, Biomédicas. Producción de una amilasa termoestable, extraída desde Anoxybacillus flavithermus, cepa aislada desde los campos geotermales de El Tatio: Modificaciones moleculares para el mejoramiento de su expresión recombinante. (Finalizada 2015)

1. Neurobiología molecular en mecanismos de ensamblaje sináptico.
2. Diseño de lentivirus para terapia génica.
3. Biología sintética basada en microorganismos extremófilos.